Dembowski, Sean K Enhancing selection and biological applications of oligonucleotide affinity reagents Ph.D. Dissertation for the Department of Chemistry, University of Minnesota-Twin Cities Minneapolis, MN 2021 SUPPLEMENTAL INFORMATION -------------------------------------------------------------------------------- Figure S.1: LDLR sequence clusters. Sequence clusters indicate highly similar sequences were obtained by AptaCluster software. Ten largest clusters (by number of sequences) are shown in decreasing order by number of sequences. Sequences are listed by read count and then by sequence name. Each cluster title line indicates the cluster name, number of sequences in the cluster, and total read count of all sequences in the cluster. Each sequence line indicates the sequence name, random region sequence, and number of reads for that sequence. >>Cluster_01, 29 sequences, 468 reads >A0004 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 359 >A0068 GCATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 11 >A0166 ACATCATGGGTTGTATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 6 >A0172 ACGTCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 6 >A0179 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGCGTAC 5 >A0197 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGCAC 5 >A0200 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTGACATCGTGTAC 5 >A0205 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCATGTAC 5 >A0213 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTTACATCGTGTAC 5 >A0216 ACATCATGGGTTTTATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 5 >A0229 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAGCATCGTGTAC 5 >A0253 ACATCACGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 4 >A0254 ACATCATGGGTCATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 4 >A0284 ACATCGTGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 4 >A0288 ACATCATGGGCTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 4 >A0294 ACATCTTGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 4 >A0316 ACATCAAGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 3 >A0322 ACATCATGGGTTATACGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 3 >A0379 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGAGTAC 3 >A0392 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTATCATCGTGTAC 3 >A0402 ACATCATGGGTTATATGCACACAAGTTTAACATCGTGTAC 3 >A0486 GCATCGTGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 2 >A0973 ACATCATGGGTTATAAGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 2 >A2026 CCATCACGGGTTATACGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 2 >A2446 ACATCATGGGTTATATGCATACAGGTTTAACATCGTGTAC 2 >A2779 ATATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 2 >A2906 ACATCATGGGTAATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 2 >A3148 ACATCACGGGTTATATGCACACAGATTTAACATCGTGTAC 2 >A4157 ACATCATGGGATATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 2 >>Cluster_02, 21 sequences, 880 reads >A0001 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 740 >A0031 TTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 23 >A0042 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATCTAAGACTCTGG 17 >A0075 CTCATACGTTTATCTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 11 >A0103 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACCCTGG 8 >A0109 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTCAAGACTCTGG 8 >A0117 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATATAAGACTCTGG 7 >A0121 CTCATGCGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 7 >A0134 CTCATACGTTTGACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 7 >A0136 CTCATACGTTTAACTTGGTTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 7 >A0140 CTCATACGTTTAGCTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 7 >A0156 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTAAAGACTCTGG 6 >A0168 CTCATATGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 6 >A0186 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGATAATTTAAGACTCTGG 5 >A0222 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGTTAATTTAAGACTCTGG 5 >A0281 CTCATACGTTTTACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 4 >A0355 GTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 3 >A0415 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACACTGG 3 >A1167 ATCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 2 >A1635 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGATTCTGG 2 >A3433 CTCATACGTTTAACTTGTTTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 2 >>Cluster_03, 20 sequences, 120 reads >A0050 CTCATACGTTTAACTTGACTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 15 >A0058 CTCATACGTTTAACTCGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 13 >A0A87 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCCAATTTAAGACTCTGG 9 >A0094 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTGAGACTCTGG 9 >A0116 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCAGG 8 >A0127 CTCATACGTTTAACTAGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 7 >A0129 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGGCTCTGG 7 >A0139 CCCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 7 >A0144 CTCATACGTTAAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 6 >A0165 CTCATACGTTCAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 6 >A0185 CTCATACGTTTAACTTGATACTGCTAATTTAAGACTCTGG 5 >A0198 CTCATACATTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 5 >A0240 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTTAGACTCTGG 4 >A0270 CTCATACGTTTAACTTGATGCTGCTAATTTAAGACTCTGG 4 >A0277 CTCATACGTTTAACTTGATCCTGCTAATTTAAGACTCTGG 4 >A0302 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCGGG 3 >A1508 CTTATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 2 >A3033 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCAAATTTAAGACTCTGG 2 >A3257 CACATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 2 >A3513 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTATGG 2 >>Cluster_04, 17 sequences, 87 reads >A0037 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGA 20 >A0063 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAACTTAAGACTCTGG 12 >A0073 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTGATTTAAGACTCTGG 11 >A0214 CTCATACGTTTAACTTGATTCTTCTAATTTAAGACTCTGG 5 >A0215 CTCATACGTTTAACTTGATTCTACTAATTTAAGACTCTGG 5 >A0225 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTTATTTAAGACTCTGG 5 >A0234 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGC 5 >A0304 CTCATACGTTTAACTTGATCCTACTAATTTAAGACTCTGG 3 >A0349 CTCATACGTTTAACTTGATTATGCTAATTTAAGACTCTGG 3 >A0385 CTCATACGATTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 3 >A0426 CTCATACGTTTAACTTGATTTTGCTAATTTAAGACTCTGG 3 >A0933 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAAATTAAGACTCTGG 2 >A1642 CTCATACGGTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG 2 >A3709 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAAGTTAAGACTCTGG 2 >A3859 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAATACTCTGG 2 >A3875 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAAACTCTGG 2 >A4053 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAACACTCTGG 2 >>Cluster_05, 16 sequences, 63 reads >A0092 ACATCATGGGTTATATGCACTCAGGTTTAACATCGTGTAC 9 >A0190 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACACCGTGTAC 9 >A0182 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAATATCGTGTAC 5 >A0237 ACATCATGGGTTATATGCACACTGGTTTAACATCGTGTAC 4 >A0241 ACATCATGGGTTATATGCTCACAGGTTTAACATCGTGTAC 4 >A0242 ACATCATGGGTTATATGCACACGGGTTTAACATCGTGTAC 4 >A0256 ACATCATGGGTTATATGCGCACAGGTTTAACATCGTGTAC 4 >A0276 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGCTTAACATCGTGTAC 4 >A0303 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAT 3 >A0328 ACATCATGGGTTATATGCACGCAGGTTTAACATCGTGTAC 3 >A0362 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTAAACATCGTGTAC 3 >A0395 ACATCATGGGTTATATGCACCCAGGTTTAACATCGTGTAC 3 >A0435 ATATCATGGGTTATATGCACACAGGTTCAACATCGTGTAC 2 >A0888 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGATTAACATCGTGTAC 2 >A1163 ACATCATGTGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC 2 >A4220 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACAACGTGTAC 2 >>Cluster_06, 15 sequences, 84 reads >A0079 TTGCATGGATTGAGTCTCATTACGTTATACATGGTCATTG 10 >A0081 TCGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG 10 >A0091 TTGCATGGATAGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG 9 >A0088 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCACTG 9 >A0114 TTGCATGGATCGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG 8 >A0119 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGCTATACATGGTCATTG 7 >A0176 TTGCATGGATTGAATTTCATTACGTTATACATGGTCATTG 6 >A0192 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTACACATGGTCATTG 5 >A0232 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTCATACATGGTCATTG 5 >A0238 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTA 4 >A0396 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGATATACATGGTCATTG 3 >A1923 TTACATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG 2 >A2141 TTGCATGGATTGAGTATCATTACGTTATACATGGTCATTG 2 >A2176 TTGCATGGATTGATTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG 2 >A2725 TCGCATGGATTGAGTCTCATTACGTTATACATGGTCATTG 2 >>Cluster_07, 14 sequences, 519 reads >A0003 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG 448 >A0100 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATTCATGGTCATTG 9 >A0110 TTGCATGGATTGGGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG 8 >A0111 TTGCACGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG 8 >A0130 TTGCATGGATTGTGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG 7 >A0131 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGACATTG 7 >A0171 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGCCATTG 6 >A0220 CTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG 5 >A0231 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACATTATACATGGTCATTG 5 >A0250 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATATATGGTCATTG 4 >A0255 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATGCATGGTCATTG 4 >A0347 TTGCATAGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG 3 >A0384 TTGCAAGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG 3 >A1419 ATGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG 2 >>Cluster_08, 11 sequences, 84 reads >A0010 AGGAGTACACAAGCATAAGTTAATCAGGGTTTCTGTCTCA 62 >A0278 AGGAGTACACAAGCATAAGTTAATCAGGGTTTCTGTCACA 4 >A0613 CGGAGTACACAAGCATAAGTTAATCAGGGTTTCTGTCTCA 2 >A1079 AGGAGTGCACAAGCATAAGTTAATCAGGGTTTCTGTCTCA 2 >A1395 AGGAGTACACAAGCATAAGTTAATCTGGGTTTCTGTCTCA 2 >A1583 AGGAGTACACAAGCATAAGATAATCAGGGTTTCTGTCTCA 2 >A1837 AGGAGTACACAAGCATAAGTCAATCAGAGTTTCTGTCTCA 2 >A2569 AGGAGTACTCAAGCATAAGTTAATCAGGGTTTCTGTCTCA 2 >A2572 AGGAGTACACAAGCATAAGTTAATCGGGGTTTCTGTCTCA 2 >A4005 AGGAGTACACAAGCATAAGTTAATCAGGGTCTCTGTCTCA 2 >A4145 AGGAGTACACAAGCATAAGTCAATCAGGGTTTCTGTCTCA 2 >>Cluster_09, 10 sequences, 93 reads >A0009 ATTGAGATAGTTTGTGAAGACTGGTCTAGCAATCATGTAA 68 >A0152 ATTGAGATAGTTTGTGAAGACTGGTCTAGCAATCGTGTAA 6 >A0393 ATCGAGATAGTTTGTGAAGACTGGTCTAGCAATCATGTAA 3 >A0423 ATTGAGGTAGTTTGTGAAGACTGGTCTAGCAATCATGTAA 3 >A0429 ATTGAGATAGTTCGTGAAGACTGGTCTAGCAATCATGTAA 3 >A1630 ATTGAGATAGTTTGTGAAGACTGGTCTATCAATCATGTAA 2 >A1904 ATTGAGATAGTTTGTGAAGACTGGCCTAGCAATCATGTAA 2 >A2507 ATTGAGATAGTTTGTGAAGACTGGTCTAGCTATCATGTAA 2 >A2909 ATTGAGATAGTTTGTGAAGTCTGGTCTAGCAATCATGTAA 2 >A4139 ATTGAGATAGTTTGTGAAGACTGGACTAGCAATCATGTAA 2 >>Cluster_10, 9 sequences, 150 reads >A0005 ATCACTCTGCATGTCAAATAGAAACGACAAAGAATCGTGA 124 >A0177 GTCACTCTGCATGTCAAATAGAAACGACAAAGAATCGTGA 5 >A0252 ATCACTCTGCATGTCAAATAGAAGCGACAAAGAATCGTGA 4 >A0280 ATCACTCTGCACGTCAAATAGAAACGACAAAGAATCGTGA 4 >A0337 ATCACTCTGCAAGTCAAATAGAAACGACAAAGAATCGTGA 3 >A0348 ATCACTCTGCATGTCAAATAGAAACGACAAAGAACCGTGA 3 >A0367 ATCACTCTGCATGTCAAATAGAAACGACAGAGAATCGTGA 3 >A1119 ATCACCCTGCATGTCAAATAGAAACGACAAAGAATCGTGA 2 >A3091 TTCACTCTGCATGTCAAATAGAAACGACAAAGAATCGTGA 2 -------------------------------------------------------------------------------- Figure S.2: LDLR sequences. Most abundant LDLR aptamer sequence candidates are ranked by read count in the sequencing pool and then listed by sequence name. Sequence entries list sequence name (without "A" and leading 0s), read count, and random region sequence. >1 740 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >3 448 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG >4 359 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC >5 124 ATCACTCTGCATGTCAAATAGAAACGACAAAGAATCGTGA >9 68 ATTGAGATAGTTTGTGAAGACTGGTCTAGCAATCATGTAA >10 62 AGGAGTACACAAGCATAAGTTAATCAGGGTTTCTGTCTCA >11 61 AGTATTCAGAGTCCAAATAGAGCAATGGTTAAGACAATCA >12 58 TGTTAAATATCGCTAGCTGAGTATTACTTGTAGGTCTTGA >13 53 CCCATCACTAGTGTCACCATGCAAGCGTCTATCCATTGCC >14 48 ATCACTATCGAAAGATTCTGATCGTAAGTAGTTTTGAACG >17 39 TCTTCATCGTAAGATTCAACGTCGATTTGATAGAGCGTAT >19 36 CGGATATGCATTCCTCATCTCCCCAATCCGTCCCAAGCCT >25 25 GTTTGAGTCAAACTTGTATCGGATCGACAATATCCACGTG >31 23 TTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >32 22 TCGTTTATATTGACGAAGTTGATCGACAGTATTTCAACAG >33 22 TACCCTGTATGTAAGCCATAAACCTTGTGATAGTTATTTG >34 21 CCTATGCGTGCTACCGTGAGGCAGCACAGAGGTCAGATG >35 20 TCTTGTTATCACTGTTCTATCCATTAGACTTATGAATGTA >37 20 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGA >38 20 CTCATACGTTTAACCTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >41 19 CTCATACGTTTAACTTGATTCCGCTAATTTAAGACTCTGG >42 17 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATCTAAGACTCTGG >46 16 CCCACTCCTCACCTTGCACACCCAGCTTGGGCTTGCTGTC >47 16 CTCATACGTCTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >49 15 TCACGCAGATTGCTAATATTACCTACCACTGTTTACTACC >50 15 CTCATACGTTTAACTTGACTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >55 13 AGATTGGTATGGTTGCACAAGAATAGCATCCATTGAAAGC >58 13 CTCATACGTTTAACTCGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >61 13 CGGATATCCTGTTGGATGGGAATACTATGGTGAGTGGAGC >62 12 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCCGG >63 12 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAACTTAAGACTCTGG >65 12 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAGGACTCTGG >68 11 GCATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC >70 11 AGGATGTTTATTCCGTTTGTTTAAATATGCCTCCAACACA >71 11 TCATATCTCTTCGCTCACTATTCGCTTATTCCTACCTCTT >73 11 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTGATTTAAGACTCTGG >75 11 CTCATACGTTTATCTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >76 11 TGCAGAGATCTAAGTCCTACATTTGTACTGTTCCGACTAT >77 11 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACGTGGTCATTG >79 10 TTGCATGGATTGAGTCTCATTACGTTATACATGGTCATTG >80 10 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAGTTTAAGACTCTGG >81 10 TCGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG >83 10 TCTATGCGTGCTACCGTGAAACAGCACAGAGGTCAGATG >85 10 CTCATACGCTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >86 9 AGCTGCTTCTTAATTTATTTCCCCGATCAAGAGTTATTGC >87 9 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCCAATTTAAGACTCTGG >88 9 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCACTG >90 9 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCGTTG >91 9 TTGCATGGATAGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG >92 9 ACATCATGGGTTATATGCACTCAGGTTTAACATCGTGTAC >94 9 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTGAGACTCTGG >97 9 CATTTTTACATCTTGCATGGCCCTTTTAGATATTTCGCAC >99 9 CTCGTACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >100 9 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATTCATGGTCATTG >101 9 AACTAATAACACCGTCTAGTAAGTTTTGTGACCGTGATTT >103 8 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACCCTGG >104 8 TTCCACCACTCTTTTTGCTGACTTCCTAAAGCATGGGGG >105 8 CTCACACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >106 8 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACACGGTCATTG >108 8 TCTTACGTAGCATGAATTTATCTCAATTAGGGATTTTGGT >109 8 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTCAAGACTCTGG >110 8 TTGCATGGATTGGGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG >111 8 TTGCACGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG >112 8 TTGCATGGATTGAGTTTCATTGCGTTATACATGGTCATTG >114 8 TTGCATGGATCGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG >116 8 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCAGG >117 7 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATATAAGACTCTGG >118 7 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTATGACTCTGG >119 7 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGCTATACATGGTCATTG >120 7 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTGTACATGGTCATTG >121 7 CTCATGCGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >122 7 ACACCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC >123 7 TTGCATGGATTGAGTTCCATTACGTTATACATGGTCATTG >126 7 TTGCATGGATTGAGTTTCATCACGTTATACATGGTCATTG >127 7 CTCATACGTTTAACTAGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >128 7 AGTCATCTGTATTCCATACTTGGTGTTAATACTCTGTCAG >129 7 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGGCTCTGG >130 7 TTGCATGGATTGTGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG >131 7 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGACATTG >132 7 TTGCATGGATTGAGTTTCATACGTTATACATGGTCATTG >133 7 TTGCGTGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG >134 7 CTCATACGTTTGACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >135 7 CTCATACGTTTAACTTGATTCAGCTAATTTAAGACTCTGG >136 7 CTCATACGTTTAACTTGGTTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >138 7 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACGTCGTGTAC >139 7 CCCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >140 7 CTCATACGTTTAGCTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >143 7 ATCACTCCGCATGTCAAATAGAAACGACAAAGAATCGTGA >144 6 CTCATACGTTAAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >146 6 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTGC >147 6 ATTCTTAGTGTAACAAACTCATCTTACAGCGTTACTGTCG >148 6 CACACCTTCGTCTTTTATACCCCACTGATATTGCGATTCC >149 6 CGTTTAGTTCAAATCTCTCAGAGCGTCGTTTGAATTCCCT >150 6 GGGGTGGGGTTGGCCAGAGGGAGGTGGATCTGGGTGTGTT >151 6 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTATTTAAGACTCTGG >152 6 ATTGAGATAGTTTGTGAAGACTGGTCTAGCAATCGTGTAA >155 6 TTGCATGGGTTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCATTG >156 6 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGCTAATTAAAGACTCTGG >157 6 AGGACTTATCATTTTCGATCATGACGTAATCTACATCCTG >158 6 ACATCATGGGTTATATACACACAGGTTTAACATCGTGTAC >160 6 CCGATCGTTTATATGAGCATATTCGAACTAACTTGAACCT >163 6 TGTCATGACAAGAATGAAACTAGTTTTCTTTTTCCCTTCA >165 6 CTCATACGTTCAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >166 6 ACATCATGGGTTGTATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC >168 6 CTCATATGTTTAACTTGATTCTGCTAATTTAAGACTCTGG >169 6 GAATGAGAATCAGTTTACGAGTATCCTTAGTCTGGTTCTC >170 6 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGTCATTG >171 6 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGCCATTG >172 6 ACGTCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGTGTAC >176 6 TTGCATGGATTGAATTTCATTACGTTATACATGGTCATTG >177 5 GTCACTCTGCATGTCAAATAGAAACGACAAAGAATCGTGA >179 5 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACATCGCGTAC >180 5 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTATACATGGTCTTTG >182 5 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAATATCGTGTAC >184 5 CCTATGTGTGCTACCGTGAAACAGCACAGAGGTCAGATG >185 5 CTCATACGTTTAACTTGATACTGCTAATTTAAGACTCTGG >186 5 CTCATACGTTTAACTTGATTCTGATAATTTAAGACTCTGG >187 5 AATTTTCTGCAAAAAAGAAAGCTCTATATTCACATATGGC >188 5 GCTAATGCGATTTGTATTACCACGTCGAGACGTATGATCG >189 5 TTGCATGGATTGAGTTTCATTACGTTAAACATGGTCATTG >190 5 ACATCATGGGTTATATGCACACAGGTTTAACACCGTGTAC >191 5 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